东莨菪碱和山莨菪碱是两种来源于天然植物的生物碱，它们在药理作用和临床应用上都具有一定的相似性和差异性。以下从化学结构、药理作用及临床用途等方面对两者进行比较分析。

化学结构上的区别

东莨菪碱（Scopolamine）和山莨菪碱（Anisodamine）均属于托品烷类生物碱，但其分子结构存在细微差别。东莨菪碱含有一个羟基和一个酯基，而山莨菪碱则缺少了东莨菪碱中的酯键部分，这使得两者的极性和溶解性有所不同。具体来说，由于缺少了酯键，山莨菪碱的脂溶性相对较低，因此其透过血脑屏障的能力较弱，中枢神经系统的副作用也相应减少。

药理作用上的差异

1. 抗胆碱能效应

两者都具有显著的抗胆碱能作用，能够抑制副交感神经末梢释放乙酰胆碱，从而产生松弛平滑肌、抑制腺体分泌等效果。然而，东莨菪碱因其较强的脂溶性更容易进入中枢神经系统，故其引起的口干、视力模糊、心率加快等症状更为明显；相比之下，山莨菪碱由于不易通过血脑屏障，其外周抗胆碱作用较强，而中枢副作用则相对较轻。

2. 对心血管系统的影响

山莨菪碱对于改善微循环障碍具有独特优势，常用于治疗感染中毒性休克、血管痉挛性疾病等。它能扩张外周血管，降低血液黏稠度，并增强心肌收缩力，有助于恢复有效循环血量。而东莨菪碱虽然也有一定的扩血管作用，但在改善微循环方面的作用不如山莨菪碱明显。

临床应用的不同之处

- 东莨菪碱主要用于麻醉前给药、晕动病预防以及某些眼科检查时的散瞳。此外，在特定情况下也可作为镇静剂使用。

- 山莨菪碱则更多地应用于临床急救领域，如急性胃肠炎、胆绞痛、肾绞痛等急腹症的辅助治疗，同时在防治术后肠麻痹、休克等方面亦有良好疗效。

综上所述，尽管东莨菪碱与山莨菪碱同属一类化合物，在抗胆碱能效应上有诸多共通之处，但由于各自独特的化学性质及生物学特性，在实际应用中展现出不同的适应症和安全性特点。合理选择使用这两种药物，可更好地满足不同病情的需求。