故事开始时，海洋中出现了一头被称为“海怪”的巨大生物，它频繁袭击各国船只，引起了全球范围内的恐慌。为了查明真相，阿龙纳斯教授受邀参加了一次捕猎行动。然而，在追捕过程中，他们的船不幸撞上了“海怪”，三人因此落入水中，却意外地发现这并非普通的海洋生物，而是一艘名为“鹦鹉螺号”的先进潜水艇。

“鹦鹉螺号”的船长尼摩是一位神秘且博学的人物，他对海洋有着深厚的感情，并利用自己的发明改变了许多人的命运。在接下来的十个月里，阿龙纳斯等人跟随尼摩船长进行了一场前所未有的海底旅行。他们穿越了太平洋、印度洋、大西洋等多个海域，见识到了许多令人惊叹的自然奇观，如珊瑚王国、亚特兰蒂斯遗迹等。同时，他们也遭遇了各种危险，比如鲨鱼袭击、冰山封路以及与土著居民的冲突。

在这段旅程中，阿龙纳斯不仅增长了见识，还深刻反思了人类社会的问题。他目睹了尼摩船长对压迫者的复仇行为，感受到了正义与道德之间的复杂关系。最终，阿龙纳斯等人设法逃脱了“鹦鹉螺号”，将这段惊心动魄的经历公之于众。而关于尼摩船长的真实身份及其最终归宿，则永远成为一个谜团。

《海底两万里》不仅仅是一部冒险小说，更是一部充满哲理思考的作品。它通过描绘未来科技的可能性，展现了人类对于未知世界的无限好奇；同时也提醒我们，无论科学技术如何进步，都应保持敬畏之心，珍惜自然环境。这部作品至今仍激励着无数读者去探索未知领域，追寻属于自己的梦想之路。